目前最有效预防流感的方法就是流感疫苗接种，不过，它是只大大降低了被流感病毒感染的几率，并不代表不会患上流感。
1、15%的人接种疫苗后不能产生抗体
一般接种疫苗后两周左右产生抗体，另外有大约15%的人对疫苗中所含抗原的刺激反应不敏感，也就不会有抗体产生，达不到预防流感的目的。
2、流感病毒每年都发生变异
流感病毒毒株几乎每年都发生变异，医药研发人员每年都要根据当年疾病流行情况、病毒变异的可能结构而配制不同的疫苗。而假如在流感流行的季节中，病毒毒株改变了，疫苗就不能提供有效保护。所以，要想有效控制流感就需要每年注射接种，但注射接种只是意味着当年被感染流感的概率降低，如果流感病毒抗原性经常不断地发生变异，疫苗的效果也会很快下降，甚至失效。>>>
3、流感疫苗对普通感冒毫无作用
流感和我们平常所说的感冒有着很大的区别。普通感冒是由多种病毒和细菌引起的，临床表现为鼻塞、流涕、打喷嚏、咽痛、声音嘶哑、流泪等常见症状，大约3到5天就会痊愈，不会造成流行，预后良好。流感是由流感病毒引起的，临床表现为高热、头痛、寒颤和干咳、全身无力、四肢酸疼、厌食等，一般要持续一两周时间。流感可引发很多并发症，如支气管炎、肺炎、中耳炎、心肌炎、心包炎以及中枢神经系统异常，甚至导致死亡。流感疫苗只针对甲、乙、丙三型流感病毒引起的感冒，却不针对其他病毒和细菌引起的普通感冒，对普通感冒只能起到缓解症状、缩短周期的作用。
4、流感疫苗也有禁忌症和副作用
许多人认为，流感疫苗就像一件保护服，谁都可以穿，穿不上就容易患感冒，穿上了只会起到防护作用，没有什么副作用。其实不然，流感疫苗是将流感病毒毒株种到鸡蛋白中，慢慢培养，再经过纯化、灭菌、提纯等工序生产出来的。因此，对鸡蛋蛋白高度过敏者或严重过敏体质的人注射疫苗后会发生急性超敏反应，不适宜接种。此外，患有格林巴利综合症、怀孕3个月内的孕妇、急性发热性疾病患者、慢性病发作期的人群等都属于流感疫苗的禁忌接种人群。
非流感疫苗禁忌接种人群在接种疫苗后，也可产生一些副作用。据北京市疾控中心主管医师吴疆介绍：有不到1%的人在接种流感疫苗后会出现发烧的症状，还有一部分人会发烧1到2天；有约10%的人在接种疫苗后，注射部位会出现轻微疼痛、红肿等反应。因为接种流感疫苗毕竟是将病毒株植入人体，因此对免疫系统还没有完全发育成熟的儿童和青少年来讲，引起的不良反应频率相对较高、症状较重。为避免这些副反应的干扰，儿童最好尽量减少年年接种。
5、正确选择品种、控制剂量
目前，流感疫苗有许多品牌和种类，国产、进口的价格又有很大差异。在选择疫苗时许多人一时无所适从，认为进口的比国产的好，或者看别人用什么自己也用什么。按产品结构来分，流感疫苗有三种，一种是全病毒流感疫苗，其接种保护效果好、价格较低，但临床副反应发生率相对较高；另一种是流感裂解疫苗，不仅接种效果好，而且临床副反应少；第三种是亚单位疫苗或称组分疫苗，是用流感病毒中部分片段做免疫原制成的，虽然其可保障临床副反应发病率低，但其保护率也相对较低。
在这三种疫苗中，全病毒流感疫苗的副作用最大，12岁以下儿童不能使用，裂解疫苗能用于各年龄段的人群。国产疫苗主要是全病毒流感疫苗，进口疫苗多为裂解疫苗，也有部分亚单位疫苗。对注射疫苗人群的跟踪观察结果显示：经过正式批准的国产疫苗质量与进口疫苗效果相当。