原则上甲状腺肿瘤在确诊后都需要进行手术切除，不过在《三国志》中已有“十人割瘿九人死”的传闻。
外科治疗
外科治疗主要涉及两个问题，一是对可疑为癌的甲状腺结节如何正确处理二是对已确诊的甲状腺癌应该采用何种最佳治疗方案。
1.对可疑甲状腺癌性结节的处理：比较合理的方案是进行筛选，对所有甲状腺结节常规做131Ⅰ扫描。除了131Ⅰ扫描显示为功能性或炎性结节外，都采用了手术探查。尤其有下列情况者更应早期手术治疗。
①不除外癌性结节。
②直径大于3～5cm囊性结节，或穿刺检查找到癌细胞或2～3次穿刺后不消失者。
③超声检查为实质性肿物。对单发结节的术式选择，由于单发结节癌的发生率高，可达5%～35%，至今又无可靠方法判断，甚至术中冰冻切片检查也有个别漏诊者，而且单纯结节摘除后，术后复发率较高。可达16.7%。因此，我们常规对甲状腺单发实性结节、囊实性结节及囊性结节4cm者均行患侧腺叶切除加峡部切除术，术中未发现淋巴结肿大者，不给颈清术。
2.对已确诊为甲状腺癌者应采用何种处理规则，要取决于患者的体质情况，癌肿的病理类型和临床分期。
（1）乳头状癌：临床上具有恶性程度低，颈淋巴结转移率高，好发于中青年妇女等特点，所以手术治疗必须考虑以上这些因素。如果癌肿局限在一侧的腺体内，可将患侧腺体连同峡部全部切除，同时行对侧腺体大部切除。但如果癌肿已侵及左右两叶，则需将两侧腺体连同峡部全部切除。手术后5年治愈率可达80%以上。临床实践证明，对没有颈淋巴结转移的乳头状腺癌不需同时清除患侧颈淋巴结，预防性颈淋巴结清除不能提高治愈率。但应强调术后随访有重要性，然而对边远山区或农村的患者缺乏随访条件应区别对待。对颈部有淋巴结肿大的患者，进行包括颈淋巴结清扫术在内的甲状腺癌联合根治术，各个国家的方案都是一致的。>>>
（2）滤泡状腺癌：虽是低度恶性甲状腺癌，但它的转移方式主要是血道转移，淋巴结转移约占20%，临床上无颈部淋巴结肿大者，一般不作预防性颈清扫术。有颈淋巴结转移者不一定同时有血道转移，所以治疗性颈清扫术还是必要的。
（3）髓样癌：恶性程度中等，常沿淋巴道及血道转移，一旦颈部淋巴结转移，即可较快浸润到包膜外，累及周围组织，所以确诊后不管临床能否扪及肿大淋巴结，一律做选择性颈淋巴结清扫术。伴有嗜铬细胞瘤者，在甲状腺手术以前首先要处理嗜铬细胞瘤，否则术中会激发高血压，影响手术顺利进行。
（4）未分化癌：由于本病病程短，进展快，首诊时大多数已失去根治机会，预后恶劣，不宜手术治疗或仅能做活检以明确诊断。但偶尔有病灶较小，适宜手术的还应积极争取作根治性手术。
化学治疗
分化型甲状腺癌对化疗反应差，仅有选择的和其他治疗方法联用于一些晚期局部无法切除或远处转移的病人。以阿霉素最有效，反应率可达30%～45%，可延长生命，甚至在癌灶无缩小时长期生存。相比而言，未分化癌对化疗则较敏感，多采用联合化疗，常用药物，阿霉素（ADM）环磷酰胺（CTX），丝裂霉素（MMC），长春新硷（VCR），如COA方案CTX0.8d1VCRl.4mgm2d1d8，ADM 30～40mgm2dl。每2l天l周期。
放射治疗
各种类型的甲状腺癌对放射线的敏感性差异很大，几乎与甲状腺癌的分化程度成正比，分化越好，敏感性越差，分化越差，敏感性越高。因此，未分化癌的治疗主要是放射治疗。甲状腺癌有一定吸碘能力。
中医治疗
甲状腺肿瘤患者常规一般采用手术治疗或不治疗，因为患者一般最初是看西医，而被诊断为甲状腺肿瘤，西医认为最好的疗法为手术治疗。但是经验证明，手术治疗术后极易复发，复发率高达88.2%，难以根治，因为手术只是一种局部的治疗方法，甲状腺肿瘤虽然生长在颈部，但是是一个全身性疾病的局部表现，对于大多数甲状腺肿瘤病人而言，局部治疗不能解决根本问题，治标不治本，实践证明，甲状腺肿瘤手术后的大量复发和转
甲状腺肿瘤移病例足以说明局部治疗难以使肿瘤得到根治；不治疗（因甲状腺良性肿瘤无明显症状：不痛、不痒、不影响说话，吃饭、睡觉、工作和学习），病程一长，气阴两伤，最终阴阳互损，成为难治之病，甚至危及生命。
中医治疗甲状腺肿瘤主要靠辨证论治，从整体观念出发，既考虑了局部的治疗，又对患者的全身状况进行系统的调理，扶正祛邪，标本兼治。我所甲状腺科研中心由数名全国着名中医甲状腺专家组成， 他们根据祖传及多年临床实践经验，精心总结出一套行之有效的特色疗法――“三联疗法”，即纯中药内服、外敷、按压。