由于新生儿免疫系统未成熟，免疫功能较差，极易发生感染，发生感染后很难局限而导致全身广泛炎性反应，病情进展较快。新生儿败血症该如何治疗呢？
抗生素治疗
新生儿败血症在未获得血培养结果之前即要选用抗生素治疗，以后根据血培养结果及细菌药敏试验选用抗生素。通常联合应用一种青霉素类和一种氨基糖甙类抗生素作为初选药物，因为这二种抗生素的配伍具有较广泛的抗菌谱并能产生协同作用。在严重感染的病例可选用第三代头孢菌素和青霉素类联合应用。
大肠杆菌败血症
一般认为脂膜早破，产程延长，产时感染以及生后3d内发病的以大肠杆菌感染为主，可选用氨苄青霉素加用庆大霉素或丁胺卡那霉素。氨苄青霉素为新生儿期细菌感染的常用药物，不仅对球菌具有强大的抗菌作用，对新生儿感染常见病原菌如大肠杆菌、流感杆菌等革兰阴性杆菌具有较高的抗菌活性。产生抗生素耐药或临床疗效不佳，可改用第三代头孢菌素。
金黄色葡萄球菌败血症
新生儿皮肤、粘膜有化脓性感染，以及医院出生且住院较长者常常以金葡菌感染为主。治疗可选用青霉素，但金黄色葡萄球菌大多数对青霉素耐药，故常用耐酸青霉素，如苯唑青霉素、邻氯青霉素、双氯青霉素，或用万古霉素加上述耐酶青霉素。
链球菌败血症
B组链球菌败血症早期的临床表现和新生儿呼吸窘迫综合征相类似，不易区别，治疗上用大剂量青霉素静脉给药。
厌氧菌败血症
近年来出现新生儿厌氧菌感染在逐渐增多，常见于胎膜早破，手术后并发症。治疗上以甲硝唑（灭滴灵）为首选药物。
院内感染所致败血症
住院后有入侵式治疗（脐静脉插管、气管插管等）长期应用广谱抗生素、病房拥挤等都易发生院内感染。凝固酶阴性葡萄球菌引起的院内感染败血症应选用万古霉素。革兰阳性细菌引起的院内感染败血症选用氨基糖甙类抗生素、如庆大霉素。但庆大霉素的耐药性很普遍，而丁胺卡那霉素的耐药性较低，常被选用。由于氨基糖甙类抗生素共同的副作用是有耳毒作用和肾脏毒性作用，因此需监测血清药物浓度。
依据细菌培养结果和药物敏感试验选用抗生素。用药原则：早用药，合理用药，联合用药，静脉给药。疗程足，注意药物毒副作用。