除了第三代试管婴儿技术，还有一项技术可以选择胎儿性别，就是精子分离术，精子比如说有的疾病会遗传给女儿但是不会遗传给儿子，这个时候就可以使用精子分离术来。很多朋友对精子分离术不是很了解，其实精子分离术现在运用不普遍的原因是，它虽然有作用，但是危害也是不能忽视的。
精子分离术，是由“美国遗传与辅助生育研究所精子分离部”发明的一种技术，用于预防“伴性遗传性疾病”在下一代身上发生。这些致病基因可以连续几代遗传，精子分离术的作用就是让患者生育正常子女，有致病基因不再传下去。精子分离术在国内的性比价比还是很高啊，国内精子分离术的价格只需要花几千元，而有相同作用的第三代试管婴儿技术却需要几万甚至十几万，所以对此之下，精子分离术性价比是非常高的。
XY精子分离术在美国确实存在，但由于法律和技术方面的局限性，被美国政府限制了使用范围，市场也并未接受。主要影响如下：
1、分离准确度很低 “XY精子分离术”的实际意义是提高得到“男性胚胎”的机率，但这些原理被证实不仅无效或低效(即分离准确度很低)，无法准确分离Y精子。即便分离出来，也可能会对采用该精子受精后形成的胚胎产生不可预知的影响。
2、滥用危害很大 美国FDA没有批准“XY精子分离术”作为“性别筛选”在临床上的使用，被限制仅可用于性连锁疾病案例，但未批准其用于性别筛选。 不批准的理由有市场和道德方面的理由，即在胚胎植入前遗传学筛查技术(PGS)普及的今天，“XY精子分离术”已经没有意义了。况且，滥用“XY精子分离术”还可能增加堕胎率。
精子分离术虽然说是一项主要用于预防胎儿患伴性遗传性疾病的技术，同时也能起到一定的胎儿性别选择作用，但是精子分离术和三代试管的区别还是有的。若我们将此技术用于预防胎儿患上遗传病、筛选胎儿的性别，也不会有什么太大的危害，但是却会产生以下几点不好之处。
1、选择性别成功的几率不高 由于Y染色体跑得会快一些，X染色体异精子跑得慢一些，而精子分离术并不是指将将X染色体精子与Y染色体精子分离，而是将活动率高的精子和活动率低的精子分离，所以精子分离术的成功率不高，只能增加性别选择的概率。
2、国外性价比不高 国内对于辅助生殖技术的管控非常严格，是不允许选择性别的，所以若想通过此技术选择胎儿性别只能去国外，而国外对于此技术的收费又比较高，可此技术选择性别的几率又不是非常高，所以这样来看，使用精子分离术选择性别的性价比是比较低的。
3、国外费用昂贵 精子分离术在国内三甲医院收费是比较透明的，做─次精子分离所需要的费用大概在1000元-2000元左右。但是国外精子分离术是比较昂贵的，并且可能会出现乱收费的情况。
